Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tubb6Q922F4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tubb6Q922F4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms