Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SncbQ91ZZ3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms