Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atpaf2Q91YY4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms