Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK0

Lrrc49, Leucine-rich repeat-containing protein 49, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc49Q91YK0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lrrc49Q91YK0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms