Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hdac11Q91WA3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms