Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps3Q91VB4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms