Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppargc1bQ8VHJ7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms