Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
SelenomQ8VHC3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SelenomQ8VHC3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms