Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hecw1Q8K4P8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hecw1Q8K4P8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms