Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PolbQ8K409 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms