Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28aQ8K3Y3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28aQ8K3Y3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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