Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y9

Ccm2, Cerebral cavernous malformations protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccm2Q8K2Y9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccm2Q8K2Y9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccm2Q8K2Y9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms