Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pacs1Q8K212 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms