Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sde2Q8K1J5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sde2Q8K1J5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms