Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpne5Q8JZW4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cpne5Q8JZW4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms