Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C1rbQ8CFG9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms