Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Nhlrc3Q8CCH2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nhlrc3Q8CCH2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms