Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ephb1Q8CBF3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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