Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aph1bQ8C7N7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Aph1bQ8C7N7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Aph1bQ8C7N7 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms