Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cnot2Q8C5L3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot2Q8C5L3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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