Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ssuh2Q8C3L1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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