Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK4

Rdh12, Retinol dehydrogenase 12, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh12Q8BYK4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh12Q8BYK4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh12Q8BYK4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms