Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Nup54Q8BTS4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Nup54Q8BTS4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms