Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSS9

Ppfia2, Liprin-alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia2Q8BSS9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia2Q8BSS9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia2Q8BSS9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms