Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ3

Bnc2, Zinc finger protein basonuclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc2Q8BMQ3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bnc2Q8BMQ3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bnc2Q8BMQ3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms