Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cyp4f39Q8BGU0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyp4f39Q8BGU0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms