Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Htatsf1Q8BGC0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Htatsf1Q8BGC0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Htatsf1Q8BGC0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Htatsf1Q8BGC0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Htatsf1Q8BGC0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Htatsf1Q8BGC0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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