Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NfascQ810U3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NfascQ810U3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms