Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ChfrQ810L3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ChfrQ810L3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms