Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dsg1bQ7TSF1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Dsg1bQ7TSF1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms