Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Actn1Q7TPR4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Actn1Q7TPR4 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.9 ms