Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim46Q7TNM2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim46Q7TNM2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms