Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Z0

Rtn4rl2, Reticulon-4 receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4rl2Q7M6Z0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rtn4rl2Q7M6Z0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rtn4rl2Q7M6Z0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms