Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ScocQ78YZ6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ScocQ78YZ6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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