Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Trappc6aQ78XR0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trappc6aQ78XR0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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