Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smim12Q78RX3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Smim12Q78RX3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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