Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GypcQ78HU7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GypcQ78HU7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms