Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rph3alQ768S4 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rph3alQ768S4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rph3alQ768S4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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