Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ssx9Q6XAS3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ssx9Q6XAS3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ssx9Q6XAS3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ssx9Q6XAS3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms