Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pcp4l1Q6W8Q3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pcp4l1Q6W8Q3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms