Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Timd4Q6U7R4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Timd4Q6U7R4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Timd4Q6U7R4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Timd4Q6U7R4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Timd4Q6U7R4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Timd4Q6U7R4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Timd4Q6U7R4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Timd4Q6U7R4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Timd4Q6U7R4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Timd4Q6U7R4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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