Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sarm1Q6PDS3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sarm1Q6PDS3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sarm1Q6PDS3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sarm1Q6PDS3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sarm1Q6PDS3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sarm1Q6PDS3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Sarm1Q6PDS3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sarm1Q6PDS3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms