Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD19

UPF0668 protein C10orf76 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6PD19 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q6PD19 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q6PD19 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q6PD19 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Q6PD19 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q6PD19 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms