Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Casc4Q6P2L7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms