Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXM2

Rcbtb1, RCC1 and BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb1Q6NXM2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rcbtb1Q6NXM2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rcbtb1Q6NXM2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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