Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cpsf6Q6NVF9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpsf6Q6NVF9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms