Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sohlh1Q6IUP1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sohlh1Q6IUP1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms