Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CltbQ6IRU5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CltbQ6IRU5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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