Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm4Q6IRU2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Tpm4Q6IRU2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Tpm4Q6IRU2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Tpm4Q6IRU2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tpm4Q6IRU2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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