Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp7Q6A4J8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp7Q6A4J8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp7Q6A4J8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp7Q6A4J8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp7Q6A4J8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp7Q6A4J8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp7Q6A4J8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp7Q6A4J8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp7Q6A4J8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms